Ученые впервые расшифровали микробиом человека, жившего в Мексике тысячу лет назад

Международная команда исследователей совершила прорыв в изучении древних людей, впервые восстановив и проанализировав кишечный микробиом молодого мужчины, жившего на территории Центральной Мексики около тысячи лет назад. Открытие стало возможным благодаря уникальной сохранности останков, известных как «человек из Симапана», которые позволили заглянуть в прошлое и узнать подробности о жизни, питании и здоровье древнего охотника-собирателя.
Останки были обнаружены в пещерном укрытии недалеко от города Симапан в Мексике. Сухой климат пещеры естественным образом мумифицировал тело, сохранив не только кости, но и фрагменты кишечной ткани, а также фекалии. Радиоуглеродный анализ показал, что возраст находки составляет примерно 936–1000 лет, то есть этот человек жил задолго до испанской колонизации Америки и принадлежал к мезоамериканской культуре отопаме.
Для определения состава древних бактерий ученые под руководством Сантьяго Росаса-Пласа из Национального автономного университета Мексики применили метод 16S рРНК-секвенирования к образцам кишечной ткани и палеофекалий. Анализ выявил несколько семейств бактерий, типичных для человеческого микробиома, таких как Peptostreptococcaceae, Enterobacteriaceae и Enterococcaceae. Особенно многочисленными оказались бактерии семейства Clostridiaceae, которые ранее уже находили в мумиях древних андских цивилизаций.
Одной из самых интригующих находок стала бактерия Romboutsia hominis. Этот вид хорошо известен в микробиоме современного человека и связан с метаболизмом углеводов и синтезом витаминов, однако до сих пор его никогда не обнаруживали в древних образцах. Это открытие подтверждает, что некоторые симбиотические бактерии сосуществовали с людьми на протяжении очень долгого времени.
Состав микробиома позволил ученым сделать выводы о рационе «человека из Симапана». Высокое содержание бактерий из семейства Lachnospiraceae, ответственных за расщепление клетчатки, указывает на диету, богатую растительной пищей — вероятно, он употреблял плоды агавы, опунции, юкки и мескита. Кроме того, обилие бактерий Clostridiaceae, способных расщеплять хитин, может быть косвенным свидетельством того, что в его питании присутствовали насекомые, что является давней традицией в этом регионе Мексики.
Погребальные детали указывают на высокий социальный статус этого человека. Его тело было тщательно завернуто в саван из местного коричневого хлопка, а затем в прочную циновку из волокон агавы. Математический анализ структуры ткани показал сложную и уникальную технику плетения, которая сейчас восстанавливается реставраторами.
Это исследование демонстрирует, как интеграция данных археологии, антропологии и микробиологии может раскрывать подробности жизни древних людей, от их пищевых привычек до социального устройства. Работа ученых расширяет знания об эволюции микробиома человека и дает ценную информацию для сравнения с современными сообществами бактерий, которые значительно изменились под влиянием урбанизации и новых диет.